- Bahan organik (terukur sebagai BOD & COD)
- Senyawa nitrogen (NH3, NO2, NO3)
- Senyawa phosphate
Senyawa nitrogen pada kadar rendah diperlukan oleh mikroba, sebagai nutrient. Apabila kadar senyawa nitrogen cukup tinggi, senyawa ini harus didegradasi menjadi N2. Sebelum didegradasi, amoniak harus dioksidasi menjadi nitrite (NO2) atau nitrat (NO3), dengan bakteri nitrificant. Nitrite dan nitrat dapat digunakan sebagai oksidator untuk memecah senyawa organik oleh bakteri denitrificant.
Phosphate dalam bentuk senyawa sederhana lebih efektif diendapkan secara kimiawi. Apabila phosphate tidak dapat diendapkan secara kimia, harus diikat dengan bakteri khusus, yang disebut bakteri pengakumulasi phosphate.